鄭文燦與賴清德俱屬民進黨新潮流系的要角，賴清德雖然後來先馳得點，先擔任了“行政院長”、“副總統”。但是在後英時期，鄭文燦兩任桃園市長及“行政院副院長”的安排，尤其擔任“行政院長”陳建仁副手期間，在“府院”間的高層默契下是有實權的副院長，甚至被稱是“地下院長”。因此這次改組，鄭文燦未能更上層樓或是進入“總統府”、“國安會”高層，這讓政治企圖心極強、身段柔軟的鄭文燦當然有相當大的失落感。
從賴清德權力布局的考量，他還要著眼於2028的連任之路，因此對其連任有威脅的鄭文燦與林佳龍，當然就無法考量出任最高首長的“行政院長”，因此相對沒威脅的卓榮泰與鄭麗君搭配就出爐。
或許這次賴清德邀請鄭文燦出任海基會董事長一職，此一靈感來自2008年馬英九邀請江丙坤一樣。江丙坤出任馬的競選總部主委，輔選有功，一度被看好是“行政院長”人選。尤其江丙坤在國親聯盟支持下，已經擔任過“立法院副院長”。當劉兆玄被宣布為馬英九首任的“行政院長”時，不少人為江丙坤叫屈，同時賴幸媛也被發布為陸委會主委，新聞鬧得沸沸揚揚，逼得“總統”當選人馬英九也及早宣布由江丙坤接下了海基會董事長，才止住為江丙坤抱不平的聲浪。而馬英九520上任後，528兩岸執政黨代表團在人民大會堂東大廳就舉行正式會談，當時兩岸執政黨領袖中國共產黨總書記胡錦濤與中國國民黨主席吳伯雄共同商定儘速促成兩會會談，隔日海基會就收到海協會的邀請函，江丙坤六月十一日就率領代表團赴北京訪問，重啟兩會復談之門，在那八年中間，兩岸在九二共識與反對“台獨”的政治互信基礎上，江丙坤與繼任的林中森，在兩岸事務上有很大的揮灑空間，與陳雲林、陳德銘、張志軍會長共同努力下，兩岸並簽署了23項協議。
因此江丙坤領導海基會的時代，當時就被形容是“院長級”領導。而後林中森以執政黨秘書長身分轉任海基會董事長，執政黨的秘書長任用與五院院長是同一等級。而海基會現任董事長李大維深受蔡英文重用，且歷練過“國安會秘書長”與“總統府秘書長”。因此賴清德以“院長級”職務來勸說鄭的首肯，鄭文燦自然不便婉拒撕破臉。一時的退讓，未來在大選的政治工程不能說沒機會。
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