（二）兩岸在機制建立的前提、目標等方面存在諸多差異
前提方面，大陸主張包括建立兩岸軍事互信在內的兩岸任何政治議題都應在“一個中國”原則下進行，“建立軍事互信是在一個中國原則基礎上的，是兩岸政治談判的結果，是兩岸關係進入和平發展階段的表現”(14)；馬英九當局主張堅持“兩岸對等”、“互不否認”的精神，“一旦談判，台灣的‘主體性’要獲得尊重”，不應有“一中前提”等附加條件，且“大陸要正視‘中華民國主權’屹立不搖的事實、正視台灣繁榮進步的成績”，正視“‘國軍’在第一線奮勇抗日”的歷史貢獻，“以堅強的‘國防’戰力為後盾”，決不能“因談判而放任軍力衰退”，並將“向美國採購更多的武器來自我防衛”，同時，馬英九還多次要求“大陸必須先撤除瞄準台灣的飛彈”，“陸委會”稱這是“必須去除的最大障礙”，“國防部”也認為須堅持“放棄武力犯台”與“對台針對性部署要減少”兩大原則，“至少放棄武力對台是必須的”。(15)
目標方面，大陸希望藉由機制的建立使兩岸關係和平發展局面得以鞏固和深化，最終實現祖國和平統一；而台灣當局推動兩岸軍事互信“並非與大陸談統一”，其軍事動機是“預防戰爭、維護台海和平穩定”，政治目的則是實現台海和平制度化，“以保護台灣安全及維護兩岸和平、區域穩定和島內安定繁榮為目標”，希望藉此使“不武”制度化，從而鞏固“不統、不獨”之現狀。(16)此外，雖然兩岸目前在經濟、社會、文化各方面交流密切，但在軍事上仍是對峙狀態——台灣仍將大陸視為最大假想敵(17)，而大陸亦未放棄以武力解決台灣問題的可能性(18)。對大陸而言，軍事互信是未來兩岸政治統一的一個過渡性安排。如果沒有“一中”的政治互信，大陸不會有意願和台灣談軍事互信；對台灣而言，由於兩岸軍事實力差距的擴大，如果大陸不能夠向台灣展現其和平發展的善意，確保用和平方式來解決兩岸關係的政治承諾，要談軍事互信機制也會很難。(19) |
